MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007613	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007613	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007613	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007613	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007613	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007613	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007613	T	7	7	302	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007613	AAC	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007613	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
11	NC_007613	CAGG	2	8	418	425	25 %	0 %	50 %	25 %	82542619
12	NC_007613	CT	3	6	443	448	0 %	50 %	0 %	50 %	82542619
13	NC_007613	ACCA	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	82542619
14	NC_007613	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
15	NC_007613	GAT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
16	NC_007613	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	82542619
17	NC_007613	CGC	3	9	568	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542619
18	NC_007613	TCG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
19	NC_007613	TTG	2	6	662	667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
20	NC_007613	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	82542619
21	NC_007613	CTG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
22	NC_007613	CCG	2	6	847	852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542619
23	NC_007613	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
24	NC_007613	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
25	NC_007613	CGG	2	6	966	971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
26	NC_007613	GCTG	2	8	973	980	0 %	25 %	50 %	25 %	82542619
27	NC_007613	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
28	NC_007613	GGAC	2	8	1011	1018	25 %	0 %	50 %	25 %	82542619
29	NC_007613	GTT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
30	NC_007613	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
31	NC_007613	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
32	NC_007613	AAT	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542619
33	NC_007613	GGC	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
34	NC_007613	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	82542619
35	NC_007613	TGC	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
36	NC_007613	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
37	NC_007613	ATC	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
38	NC_007613	TG	3	6	1433	1438	0 %	50 %	50 %	0 %	82542619
39	NC_007613	AAG	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542619
40	NC_007613	GGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
41	NC_007613	TCT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
42	NC_007613	GAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
43	NC_007613	TCA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
44	NC_007613	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
45	NC_007613	GCTG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	50 %	25 %	82542619
46	NC_007613	GCG	2	6	1836	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
47	NC_007613	GAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542619
48	NC_007613	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
49	NC_007613	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
50	NC_007613	CCAG	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	82542619
51	NC_007613	CTT	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
52	NC_007613	TCG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
53	NC_007613	TAC	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
54	NC_007613	GCG	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
55	NC_007613	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
56	NC_007613	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
57	NC_007613	ACT	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
58	NC_007613	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
59	NC_007613	ATTGAA	2	12	2429	2440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82542619
60	NC_007613	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
61	NC_007613	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542619
62	NC_007613	CG	4	8	2524	2531	0 %	0 %	50 %	50 %	82542619
63	NC_007613	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
64	NC_007613	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
65	NC_007613	TGCC	2	8	2593	2600	0 %	25 %	25 %	50 %	82542619
66	NC_007613	TAT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542619
67	NC_007613	TGC	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
68	NC_007613	GCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
69	NC_007613	GGC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
70	NC_007613	CAA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542620
71	NC_007613	GCAA	2	8	3028	3035	50 %	0 %	25 %	25 %	82542620
72	NC_007613	GGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542620
73	NC_007613	ATGA	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	82542620
74	NC_007613	GCA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542620
75	NC_007613	TGG	2	6	3242	3247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542620
76	NC_007613	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
77	NC_007613	GAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542620
78	NC_007613	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542620
79	NC_007613	CAGC	2	8	3281	3288	25 %	0 %	25 %	50 %	82542620
80	NC_007613	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
81	NC_007613	CGC	2	6	3384	3389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542620
82	NC_007613	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	82542620
83	NC_007613	CTGG	2	8	3417	3424	0 %	25 %	50 %	25 %	82542620
84	NC_007613	TTCA	2	8	3426	3433	25 %	50 %	0 %	25 %	82542620
85	NC_007613	TGA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
86	NC_007613	AGCG	2	8	3563	3570	25 %	0 %	50 %	25 %	82542620
87	NC_007613	TCCGGC	2	12	3576	3587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	82542620
88	NC_007613	TG	3	6	3604	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	82542620
89	NC_007613	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
90	NC_007613	T	6	6	3819	3824	0 %	100 %	0 %	0 %	82542621
91	NC_007613	CTGA	2	8	3849	3856	25 %	25 %	25 %	25 %	82542621
92	NC_007613	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
93	NC_007613	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
94	NC_007613	GC	3	6	3959	3964	0 %	0 %	50 %	50 %	82542621
95	NC_007613	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
96	NC_007613	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
97	NC_007613	TGA	3	9	4322	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
98	NC_007613	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542621
99	NC_007613	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	82542621
100	NC_007613	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
101	NC_007613	CTG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
102	NC_007613	TGC	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
103	NC_007613	ACG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542621
104	NC_007613	AAC	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542621
105	NC_007613	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542621
106	NC_007613	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542621
107	NC_007613	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
108	NC_007613	AG	3	6	4880	4885	50 %	0 %	50 %	0 %	82542621
109	NC_007613	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542621
110	NC_007613	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
111	NC_007613	TGA	3	9	4999	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
112	NC_007613	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542621
113	NC_007613	T	6	6	5069	5074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007613	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007613	AAC	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007613	CGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007613	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542622
118	NC_007613	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542622
119	NC_007613	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542622
120	NC_007613	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542622
121	NC_007613	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542622
122	NC_007613	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542622
123	NC_007613	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542622
124	NC_007613	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542622
125	NC_007613	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542622
126	NC_007613	AT	3	6	5611	5616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007613	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007613	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
129	NC_007613	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542623
130	NC_007613	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542623
131	NC_007613	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542623
132	NC_007613	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	82542623
133	NC_007613	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542623
134	NC_007613	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542623
135	NC_007613	TGA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542623
136	NC_007613	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542623
137	NC_007613	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542623
138	NC_007613	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542623
139	NC_007613	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
140	NC_007613	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542623
141	NC_007613	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542623
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144	NC_007613	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
145	NC_007613	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542623
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147	NC_007613	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007613	TGC	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542624
149	NC_007613	ATG	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542624
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152	NC_007613	GTG	2	6	6816	6821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542624
153	NC_007613	A	6	6	7019	7024	100 %	0 %	0 %	0 %	82542625
154	NC_007613	GTGAT	2	10	7065	7074	20 %	40 %	40 %	0 %	82542625
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160	NC_007613	AATCTG	2	12	7346	7357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82542625
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164	NC_007613	ATC	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_007613	TTA	2	6	8059	8064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007613	CAG	2	6	8162	8167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_007613	CG	3	6	8329	8334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_007613	CGG	2	6	8476	8481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_007613	CG	3	6	8521	8526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
176	NC_007613	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_007613	A	6	6	8721	8726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_007613	GCAT	2	8	8731	8738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
180	NC_007613	AAG	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_007613	TA	3	6	8800	8805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_007613	GGCG	2	8	8862	8869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
183	NC_007613	CGG	2	6	8926	8931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_007613	CGT	2	6	8946	8951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_007613	ATC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_007613	CGCAG	2	10	9135	9144	20 %	0 %	40 %	40 %	82542626
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233	NC_007613	GAAT	2	8	11291	11298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
234	NC_007613	AAT	2	6	11304	11309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_007613	ATA	2	6	11345	11350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_007613	GAAAAT	2	12	11388	11399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_007613	T	6	6	12131	12136	0 %	100 %	0 %	0 %	82542629
251	NC_007613	GTC	2	6	12160	12165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_007613	CAGT	2	8	12272	12279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
253	NC_007613	CTT	2	6	12288	12293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_007613	GGC	2	6	12334	12339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_007613	TGT	2	6	12456	12461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542630
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257	NC_007613	GCCA	2	8	12550	12557	25 %	0 %	25 %	50 %	82542630
258	NC_007613	CAG	2	6	12590	12595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542630
259	NC_007613	AGA	2	6	12600	12605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542630
260	NC_007613	TCC	2	6	12655	12660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542630
261	NC_007613	CAGC	2	8	12683	12690	25 %	0 %	25 %	50 %	82542630
262	NC_007613	ATCAC	2	10	12747	12756	40 %	20 %	0 %	40 %	82542630
263	NC_007613	T	6	6	12797	12802	0 %	100 %	0 %	0 %	82542630
264	NC_007613	CAC	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542631
265	NC_007613	AGGA	2	8	13023	13030	50 %	0 %	50 %	0 %	82542631
266	NC_007613	ATGGAA	2	12	13037	13048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82542631
267	NC_007613	CAT	2	6	13073	13078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542631
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269	NC_007613	A	6	6	13130	13135	100 %	0 %	0 %	0 %	82542631
270	NC_007613	TGA	2	6	13153	13158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542631
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272	NC_007613	AGTG	2	8	13192	13199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_007613	GAA	2	6	19071	19076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542636
404	NC_007613	TGA	2	6	19175	19180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542636
405	NC_007613	TGA	2	6	19189	19194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542636
406	NC_007613	GAT	2	6	19334	19339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542636
407	NC_007613	CGG	2	6	19348	19353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542636
408	NC_007613	ATT	2	6	19375	19380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542636
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410	NC_007613	GGA	2	6	19435	19440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
411	NC_007613	ATT	2	6	19481	19486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_007613	ATT	2	6	19501	19506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_007613	AATA	2	8	19525	19532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_007613	CTTC	2	8	19547	19554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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419	NC_007613	ATT	2	6	19807	19812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_007613	CAT	2	6	20835	20840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_007613	CAT	2	6	22974	22979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542642
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